A Heráldica do Colégio Sete Fontes é constituída por um brasão, uma bandeira e um selo.

Brasão de Armas

De azul, livro de ouro, aberto, encadernado do mesmo, realçado de negro e pintado de púrpura, acompanhado, em orla, por sete fontes heráldicas de azul e prata, postas três em chefe e duas em cada flanco. Coroa académica de ouro, com sua pedraria. Listel branco com a legenda a negro: LEVA TE SUPRA TE.
 
Neste brasão está representada a carga simbólica da localização do Colégio nas Sete Fontes, zona de grande interesse histórico e arqueológico. Estas fontes abasteciam de água a cidade de Braga. De destacar que a água é fonte de vida de onde brota, sendo imagens a sabedoria, a tolerância e a solidariedade. No centro do brasão está o livro, como símbolo da sabedoria, onde conflui a água que irriga, ilumina e anima a sabedoria.

Bandeira
Amarela, lisa. Se quadrada, com um metro, com cordões e borlas de azul e ouro, terá, ao centro, o primeiro ordenamento acima descrito, sendo a haste e a lança de prata. Se rectangular, respeitará as proporções de um, ao alto, para um e meio, ao largo, tendo, ao centro, o segundo ordenamento acima descrito